Білок-ліпідні взаємодії як модулятор агрегаційної поведінки білків
Вантажиться...
Дата
2016
Автори
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна
Анотація
Дисертаційна робота присвячена дослідженню ролі білок-ліпідних взаємодій у
процесі патологічної агрегації білків. Запропоновано новий підхід, що дозволяє
оцінити структурні параметри амілоїдних фібрил, такі як молекулярний об’єм
мономерної субодиниці та фрактальна розмірність агрегатів, на основі вимірювань
ефективності індуктивно-резонансного переносу енергії між амілоїд-специфічними
флуорофорами. Охарактеризовані структурні особливості фібрилярного лізоциму у
розчині. Розроблено нову методологію визначення ступеня олігомеризації білків на
мембранній матриці, що базується на комплексній інтерпретації даних
стаціонарного і часороздільного міжмолекулярного переносу енергії. Розраховані
параметри олігомеризації лізоциму у ліпідному оточенні – ступінь агрегації та
відстань між мономерами в агрегаті. З використанням ряду флуоресцентних зондів
охарактеризовано вплив префібрилярних та фібрилярних агрегатів лізоциму та N-
термінального фрагменту аполіпопротеїну А-І на структурно-динамічний стан та
фізико-хімічні властивості модельних ліпідних мембран різного складу. Розроблена
нова стратегія дослідження топологічних модифікацій фібрилярних агрегатів, що
базується на аналізі результатів вимірювання ІРПЕ між мембранозв’язаним
флуорофором та амілоїд-специфічним зондом методом Монте-Карло. Отримані
докази на користь структурної трансформації амілоїдних фібрил аполіпопротеїну А-
І при асоціації з ліпідами. Методом молекулярної динаміки вперше проведено
дослідження ролі мембран в утворенні агрегаційно-компетентної конформації
лізоциму, цитохрому с та N-термінального фрагменту аполіпопротеїну А-І.
Опис
Ключові слова
агрегація білків, амілоїдні фібрили, ліпідний бішар, індуктивно-резонансний перенос енергії, флуоресцентні зонди, мікроскопія, молекулярна динаміка
Бібліографічний опис
Дисертація на здобуття наукового ступеня доктора фізико-математичних наук